不同的氨基酸帶有不同化學性質的側鏈基團,有的帶有堿性側鏈,有的帶有酸性側鏈,由此組成的蛋白質具有不同數目的堿性基團和酸性基團,這些基團會使蛋白質在不同的pH溶液中帶有不同的凈電荷,整個蛋白質分子帶正電荷多,即為堿性蛋白(等電點偏向酸性);整個蛋白質帶負電荷多,即為酸性蛋白質(等電點偏向酸性)。利用蛋白質的兩重性(酸堿性)及與酸性和堿性染料離子形成鹽的能力,在pH=2.2(即所有蛋白質等電點之下),全部蛋白質能被固綠染色;在pH=8.1~8..2范圍內,堿性蛋白質被固綠染色。
Leagene堿性固綠染色液是利用堿性蛋白質與帶有負電荷的堿性染料固綠結合進行染色,細胞中含量最為豐富的堿性蛋白為組蛋白,主要存在于細胞核中,因此染色后細胞核大部分被染成綠色。該試劑僅用于科研領域,不適用于臨床診斷或其他用途。